24 октября 1945 года вступил в силу Устав ООН. Этот день считается днём образования этой универсальной организации, объединяющей 193 государства.

На протяжении многих лет АТЦ СНГ взаимодействует с профильными подразделениями ООН: Контртеррористическим управлением, Исполнительным директоратом КТК, Мониторинговой группой санкционных комитетов СБ ООН, Региональным центром по превентивной дипломатии в Центральной Азии, внося вклад в международное контртеррористическое сотрудничество и дополняя усилия ООН на региональном уровне.

В 2018 году между АТЦ СНГ и ООН подписан Меморандум о взаимопонимании, формализовавший отношения двух организаций и ставший новым этапом развития сотрудничества, ежегодно наполняющегося практическим содержанием.