自独联体反恐中心成立以来，已经准备和进行了十九次联合反恐演习（以下简称演习），在以下地区进行：
亚美尼亚共和国（“原子反恐-2006”，“阿拉拉特反恐-2019”）;
白俄罗斯共和国（“堡垒反恐-2008”,“网络反恐–2016”）;
哈萨克斯坦共和国（“里海反恐-2005”,“拜科努尔反恐-2007”，“捷提苏反恐-2014”,“里海反恐-2021”）;
吉尔吉斯共和国（“南部反恐-2001”,“阿拉图反恐-2013”，“伊塞克库尔反恐–2018”，“欧亚反恐–2023”）, 摩尔多瓦共和国（“西部反恐-2004”）;
俄罗斯联邦（“顿河反恐-2012”，“共同体反恐–2022”）;
塔吉克斯坦共和国（“南部反恐-2002”，“杜尚别反恐-2017”）;
乌克兰（“亚速海反恐-2003”，“顿巴斯反恐–2011”）。
演习的主要目的是通过协调行动算法来防止和制止恐怖主义行为，提高安全机构，特殊服务和其他执法机构共同打击恐怖主义和极端主义的准备程度。
在演习期间，涉及以下问题：
主管当局组织和采取协调行动，以查明和制止计划在成员国国家领土上实施恐怖主义行为的人员活动;
成员国在危机局势解决过程中的信息互动; 使用安全机构和特殊部队参与解救人质和预防针对关键设施的恐怖威胁的特别军事行动；
使用武装部队，国民警卫队和其他单位来解决封锁和摧毁大规模非法武装恐怖主义组织的任务。
为了在组织方法上提供保障,培训独联体国家安全和情报机关的雇员,以便在独联体反恐中心演习期间执行实际任务,自2010年起开始并实施了一个关于组织独联体成员国主管机构有关单位在演习期间相互协调的实际训练课程。
这些课程使得演习执行任务之前，成员国的安全机构和特殊部队的员工能够详细分析，并在必要时调整现有的互动机制，以测试成员国国家主管机构实践组成部分的新要素。
这些实践课程有助于组织成员国的主管机构在进行反恐行动时最有效地互相协作，并且是培训员工执行实际任务的一种形式。
