Основными партнерами Центра из числа международных организаций являются:
КОНТРТЕРРОРИСТИЧЕСКОЕ УПРАВЛЕНИЕ ООН
КОНТРТЕРРОРИСТИЧЕСКИЙ КОМИТЕТ СОВЕТА БЕЗОПАСНОСТИ ООН
УПРАВЛЕНИЕ ООН ПО НАРКОТИКАМ И ПРЕСТУПНОСТИ
МЕЖДУНАРОДНАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ УГОЛОВНОЙ ПОЛИЦИИ - ИНТЕРПОЛ
ОРГАНИЗАЦИЯ ПО БЕЗОПАСНОСТИ И СОТРУДНИЧЕСТВУ В ЕВРОПЕ (ОБСЕ)
РЕГИОНАЛЬНАЯ АНТИТЕРРОРИСТИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА ШАНХАЙСКОЙ ОРГАНИЗАЦИИ СОТРУДНИЧЕСТВА
ОРГАНИЗАЦИЯ ДОГОВОРА О КОЛЛЕКТИВНОЙ БЕЗОПАСНОСТИ
Взаимодействие с ними строится в рамках соглашений, договоров, меморандумов и протоколов о сотрудничестве, в ряде организаций Центр представлен в качестве наблюдателя (Интерпол, CDCT, ЕАГ).
АТЦ СНГ активно взаимодействует с контртеррористическими структурами ООН: Контртеррористическим управлением (КТУ ООН), Исполнительным директоратом Контртеррористического комитета Совета Безопасности (ИД КТК СБ ООН), Группой по аналитической поддержке и наблюдению за санкциями Комитета СБ ООН, учрежденного резолюциями 1267 (1999), 1989 (2011) и 2253 (2015), и Комитета СБ ООН, учрежденного резолюцией 1988 (2011), осуществляющих контроль за санкциями против международных террористических организаций – ИГИЛ, Аль-Каида и Талибан.
Приоритетным направлением сотрудничества АТЦ СНГ с контртеррористическими структурами ООН является взаимодействие с Региональным Центром ООН по превентивной дипломатии для Центральной Азии (РЦПДЦА), который ежегодно проводит встречи по координации усилий специализированных международных организаций, работающих в странах Центральной Азии.
В 2016 году АТЦ СНГ стал членом Глобальной исследовательской сети ИД КТК СБ ООН, а в 2021 году является участником Глобальной экспертной сети ООН по защите уязвимых объектов от террористических угроз, созданной КТУ ООН в рамках Глобальной программы по защите уязвимых целей.
Центр приглашается для проведения тематических брифингов для санкционных комитетов СБ ООН по ИГИЛ, Аль-Каиде и Талибану. Сотрудники АТЦ СНГ привлекаются в качестве региональных экспертов в визитах Исполнительного директората КТК ООН, осуществляемых с целью мониторинга и обеспечения реализации контртеррористических резолюций СБ ООН. Информация Центра учитывается при подготовке итоговых отчетов ИД КТК для Совета Безопасности ООН.
Взаимодействие Центра с ОБСЕ осуществляется через антитеррористическое подразделение Департамента транснациональных угроз и участие в мероприятиях структур Секретариата ОБСЕ в Центральной Азии. Центр регулярно готовит и направляет информацию в Вестник контртеррористической сети ОБСЕ.
В 2009 году АТЦ СНГ был предоставлен статус наблюдателя в Комитете экспертов Совета Европы по борьбе с терроризмом (CODEXTER, в настоящее время – CDCT). Центр принимает участие в заседаниях Комитета и его рабочих групп.
Интенсивно развивается сотрудничество с Евразийской группой по противодействию легализации преступных доходов и финансированию терроризма. Сотрудники Центра принимают участие в пленарных заседаниях ЕАГ, семинарах по обмену опытом по исполнению требований ФАТФ в выявлениях виртуальных активов террористов, а также заседаниях Рабочих групп, целью которых является проведение исследований и выдача рекомендаций в области оценки рисков финансирования терроризма для стран Евразийского пространства.
Взаимодействие АТЦ СНГ с Международной организацией уголовной полиции – Интерпол строятся на основе Меморандума о взаимопонимании по вопросам сотрудничества и взаимодействия в области обмена информацией в сфере борьбы с терроризмом. Центр принимает участие в Европейских региональных конференциях Интерпола и Генеральных Ассамблеях в качестве наблюдателя, а также проекте «Калкан», нацеленном на обмен информацией о террористических организациях и связанных с ними лицах.
С 2008 года в АТЦ СНГ действует абонентский пункт Интерпола с онлайн доступом к его банкам данных посредством подключения к Глобальной полицейской коммуникационной системе I-24/7.
На региональном уровне основными партнерами Центра выступают РАТС ШОС и ОДКБ. Основу двухстороннего взаимодействия с ними составляют соглашения, подписанные в 2006 (новая редакция в 2023 году) и 2013 году соответственно, а также Меморандум по вопросам сотрудничества и взаимодействия между АТЦ СНГ, Секретариатом ОДКБ и РАТС ШОС от 28 мая 2018 года, в рамках которого регулярно проводятся заседания постоянно действующей экспертной группы.
Значимым результатом этой работы стала разработка Согласованной позиции РАТС ШОС, АТЦ СНГ и Секретариата ОДКБ по вопросам противодействия терроризму и экстремизму, подписание которой состоялось 16 февраля 2022 года.
В рамках двухстороннего сотрудничества Центр принимает участие в рабочей группе по Афганистану при СМИД ОДКБ, ежегодной конференции РАТС ШОС.
Построение эффективной системы антитеррористического сотрудничества было бы невозможным без задействования потенциала органов СНГ и их рабочих структур.
