Антитеррористическое взаимодействие стран Содружества осуществляется на основе Программы сотрудничества государств – участников СНГ в борьбе с терроризмом и экстремизмом, основным разработчиком которой является АТЦ СНГ.
Программа утверждается Советом глав государств СНГ и нацелена на укрепление и развитие совместного антитеррористического потенциала стран Содружества.
Достижению этой цели способствует проведение АТЦ СНГ ряда организационных мероприятий.
Так, в ежегодном формате организуется Совещание руководителей (начальников штабов) национальных антитеррористических центров государств – участников СНГ. Спектр рассматриваемых вопросов весьма широк – от анализа влияния глобальных политических и социально экономических процессов на рост террористической активности до выработки совместных мер компетентных органов стран СНГ.
Вопросы совершенствования практики взаимодействия компетентных органов стран Содружества в ходе проведения совместных и/или согласованных мероприятий обсуждаются в ходе ежегодного Сбора руководящего состава антитеррористических подразделений органов безопасности и специальных служб государств – участников СНГ.
Неотъемлемым элементом данной работы является ежегодное проведение Региональных экспертных консультаций представителей практических подразделений органов безопасности, специальных служб и правоохранительных органов государств – участников СНГ по борьбе с терроризмом и экстремизмом. В ходе консультаций проводится оценка обстановки на территориях стран Содружества, в том числе в Центрально-Азиатском регионе, обусловленной деятельностью МТО, осуществляется обмен накопленным антитеррористическим опытом, вырабатываются совместные меры по противодействию террористическим угрозам.
Эффективным инструментом обеспечения взаимодействия АТЦ СНГ и компетентных органов является постоянно действующее Совещание при Руководителе Центра с участием полномочных представителей стран Содружества при АТЦ СНГ. В ходе ежеквартально проводимых заседаний рассматриваются обстановка в сфере противодействия терроризму и экстремизму на территории каждого государства СНГ и вопросы совершенствования межгосударственного сотрудничества.