АТЦ СНГ тесно взаимодействует с уставными органами и органами отраслевого сотрудничества СНГ (их рабочими структурами):
- Исполнительным комитетом СНГ
- Координационной службой Совета командующих Пограничными войсками
- Секретариатом Совета министров обороны государств – участников СНГ
- Советом министров внутренних дел и Бюро по координации борьбы с организованной преступностью и иными опасными видами преступлений на территории государств – участников СНГ
- Комитетом глав правоохранительных подразделений Совета руководителей таможенных служб государств – участников СНГ
- Межпарламентской Ассамблеей СНГ
- Секретариатом Координационного совета генеральных прокуроров государств – участников СНГ
- Советом руководителей миграционных органов государств – участников СНГ
- Советом руководителей подразделений финансовой разведки государств – участников СНГ
- Советом руководителей пенитенциарных служб государств – участников СНГ
- Координационным транспортным совещанием государств – участников СНГ
- Координационным советом руководителей органов налоговых (финансовых) расследований государств – участников СНГ
- Межгосударственным авиационным комитетом (МАК).
Антитеррористический центр СНГ активно развивает рабочие контакты с партнерами по международному антитеррористическому сообществу:
• Исполнительным директоратом Контртеррористического комитета Совета Безопасности ООН (ИД КТК СБ ООН)
• Контртеррористическим управлением ООН (КТУ ООН)
• Группой по аналитической поддержке и наблюдению за санкциями Комитета СБ ООН, учрежденного резолюциями 1267 (1999), 1989 (2011) и 2253 (2015), и Комитета СБ ООН, учрежденного резолюцией 1988 (2011), осуществляющих контроль за санкциями против международных террористических организаций – ИГИЛ, Аль-Каида и Талибан
• Департаментом транснациональных угроз Секретариата ОБСЕ
• Международной организацией уголовной полиции Интерпол. • Комитетом Совета Европы по борьбе с терроризмом (СDCT)
• Региональной антитеррористической структурой Шанхайской организации сотрудничества (РАТС ШОС)
• Секретариатом Организации Договора о коллективной безопасности (ОДКБ)
• Евразийской группой по противодействию легализации преступных доходов и финансированию терроризма (ЕАГ)
• Секретариатом Парламентской Ассамблеи ОДКБ
• Центральноазиатским региональный информационный координационным центром по борьбе с незаконным оборотом наркотических средств, психотропных веществ и их прекурсоров (ЦАРИКЦ).
Взаимодействие АТЦ СНГ со специализированными международными структурами имеет разновекторную направленность. Центр выступает в качестве информационного партнера для ведущих международных акторов, участвует в контртеррористических конференциях и семинарах.
Важным и закономерным решением стало подписание в 2018 году Меморандума о взаимопонимании между Антитеррористическим центром СНГ и Организацией Объединенных Наций в лице ее Контртеррористического управления.
Благодаря подписанному документу обе стороны получили возможность инициировать совместные проекты и программы в области борьбы с терроризмом для поддержки сбалансированной имплементации Глобальной контртеррористической стратегии ООН, осуществлять обмен информацией, проводить совместные мероприятия и консультации в области предотвращения и борьбы с терроризмом.
Ранее, в 2016 году АТЦ СНГ стал членом Глобальной исследовательской сети ИД КТК СБ ООН, а в 2021 году Центр присоединился к Глобальной экспертной сети ООН по защите уязвимых объектов от террористических угроз. Центр приглашается для проведения тематических брифингов для санкционных комитетов СБ ООН по ИГИЛ, Аль-Каиде и Талибану. Сотрудники АТЦ СНГ привлекаются в качестве региональных экспертов в визитах Исполнительного директората КТК ООН, осуществляемых с целью мониторинга и способствования реализации контртеррористических резолюций СБ ООН.
Информация Центра учитывается при подготовке итоговых отчетов ИД КТК для Совета Безопасности ООН. АТЦ СНГ имеет статус постоянного наблюдателя на мероприятиях Комитета Совета Европы по борьбе с терроризмом, генассамблеях Интерпола, пленарных заседаниях ЕАГ.
Новым направлением стала организация совместно с Программным офисом ОБСЕ в Бишкеке учебных курсов по повышению квалификации сотрудников компетентных органов. В феврале 2022 года состоялось подписание Совместной позиции ИК РАТС ШОС, АТЦ СНГ и Секретариата ОДКБ по вопросам противодействия терроризму и экстремизму. Документ декларирует общие подходы по вопросам противодействия международному терроризму и экстремизму, поддержку Сторонами резолюции Совета Безопасности ООН 2354 (2017).
АТЦ СНГ имеет статус постоянного наблюдателя на мероприятиях Комитета Совета Европы по борьбе с терроризмом, генассамблеях Интерпола, пленарных заседаниях ЕАГ. Центр принимает активное участие в проекте «Калкан» Генерального секретариата Интерпола.
С 2008 года в АТЦ СНГ действует абонентский пункт Интерпола с онлайн доступом к его банкам данных посредством подключения к Глобальной полицейской коммуникационной системе I-24/7.
